深圳专利申请公司代办专利的流程如下：
一、确定发明创造是否属于专利法保护的内容
确定发明创造是否属于专利法保护的内容，并根据发明创造的内容来决定申请哪一种专利类型(发明专利、实用新型专利、外观设计专利)。
签订代理协议的目的是为了明确申请人与深圳专利申请公司之间的权利和义务，同时约束深圳专利申请公司对发明创造的内容保密。
申请人需要向专利代理人提供有关发明创造的背景资料并委托检索有关内容；还需要详细介绍发明创造的内容，以帮助专利代理人更好的充分了解发明创造的内容。
专利代理人根据对发明创造的充分了解，对专利申请的前景作出初步判断，授权可能性非常小的专利申请将会建议申请人撤回，此时深圳专利申请公司将收取少量的咨询费用。对授权可能性不小的专利申请，专利代理人将提出明确的申请方案、保护范围和内容，并在征得申请人同意的情况下开始准备正式的申请工作。
专利代理人将撰写专利申请文件，并制作申请书文件。
专利局将对专利申请进行审查，专利代理人在审查程序中按照专利局的要求进行专利补正、意见陈述、答辩、变更等工作，申请人应配合专利代理人完成上述工作。
根据审查结果，专利局将决定授权或是驳回，外观设计专利的审查时间一般为6个月左右，实用新型专利一般为10—12个月，发明专利一般为1—2年，具体时间因发明创造的内容以及审查员的审查速度而异。
专利申请被授权的，申请人应当按照授权通知书的要求办理授权登记手续，领取专利证书。专利申请被驳回的，申请人应根据具体情况决定是否提出复审请求。至此，深圳专利申请公司代办专利的流程结束。
